香港環保標誌計劃在堅持六大原則的基礎上得以成功啟動，由此產生了既與國際慣例接軌又符合本港實際情況的香港環保標誌認證。以ISO14020標準體系為基礎，香港環保標誌建立了一套科學完整的認證體系。這一體系的核心要素有兩點，一是認證辦法與思想，二是環保標誌的產品標準。
為確保計劃成功實施，確保香港環保標誌的科學性、嚴謹性、公正性和權威性，香港環保標誌以符合生命週期的認證辦法與思想為指針，建立了如下認證程式：
一、認證申請
1、申請認證的基本條件
1)申請企業的登記註冊證明；
2)申請企業的商標註冊證明；
3)產品在香港環保標誌認證的標準目錄範圍之內；
4)產品質量穩定可靠，具備批量生產能力；
5)申請產品應為企業主導產品（申請認證前12個月內產量占總產品20%以上）；
6)產品依據認證機構確認的產品質量執行標準組織生產；
7)申請方的生產組織過程中滿足所在地區的環保法規、和節能減排要求；
8)產品的環保性能符合認證的相關要求；
2、認證申請企業需提交的材料
1)《香港環保標誌認證申請書》一式兩份；
2)申請企業陳述/簡介；
3)企業登記註冊證明文件複印件（如申請企業非生產工廠，則應提供申請方及生產工廠雙方的證明材料）；
4)產品注冊商標複印件；
5)產品現執行/明示的質量、安全、衛生標準；
6)認可檢驗機構出具的產品質量合格檢驗報告；
7)滿足所在地區環保法律法規的證明檔；環境監測部門出具有效期內的污染物排放檢測報告，且企業應負法律責任的環境自查聲明；
8)申請認證產品目錄及規格說明書；
9)產品結構圖，電路圖及實現產品環保節能節水性能的說明或試驗報告；
10)產品整體彩色照片、或圖冊；
11)申請企業質量管理程式檔；
12)申請企業如獲ISO9001-2000或ISO14001-2004認證需提供認證證書；
13)其他相關的證書及文件。
3、由認證申請企業向香港環境保護總會領取並填寫《香港環保標誌認證申請書》，然後連同認證所需資料報香港環境保護總會。
二、檔審查和受理認證申請
1、文件審查
香港環境保護總會接到申請企業提交的材料後，於10個工作日內完成對申請書及相關材料的初審工作，對符合要求或基本符合要求的企業發出《（補充）材料評審通知單》和《受理環保標誌認證通知書》；對不符合環保標誌認證申請條件和要求的企業則發出《不與受理環保標誌認證通知書》。
2、與申請企業簽訂認證合同
香港環境保護總會給申請企業發出受理通知以後，同時根據申請企業的情況核算認證費用，香港環境保護總會還將發出《香港環保標誌認證合同》（一式兩份）確定認證範圍（包括產品名稱、受評審方、產品商標）、認證付費要求和時機、雙方責任和義務等內容。如申請方對合同內容及認證費用無異議，簽訂認證合同書。合同書有效期為三年，如果認證範圍（包括認證產品類型、生產地等）沒有變更，只是產品系列擴項認證時不再另行簽訂合同書。
三、組成評審組和確定評審計劃
認證合同簽訂以後，申請企業應在合同規定的時間內交納認證費用。同時香港環境保護總會組成評審組，確定評審組人員，由評審組編制《評審計劃》，包括檔評審、工廠審查、產品抽送樣檢驗。申請企業如已獲ISO9001-2000或ISO14001-2004認證且已提供有效期內認證證書的，評審組可根據情況免予工廠審查。如確定需工廠審查，則通知申請企業確認。
四、評審的實施工廠審查的實施和產品抽樣檢驗
1、申請文件的評審
評審組對企業提交材料評定，並提出整改意見。申請企業如已獲ISO9001-2000或ISO14001-2004認證且已提供有效期內認證證書的，評審組可根據情況免予工廠審查。如確定需工廠審查，則通知申請企業確認。
2、工廠審查
確定需工廠審查的，評審組按照《評審計劃》，依據《工廠審查要求》及申請方提交的材料，對受評審方進行工廠審查。
不合格項整改：
a)現場審查中，如發現不合格項，由評審組提出《不合格報告》，企業應在規定的期限內進行整改，（一般一個月，最長不超過三個月）並提交《糾正報告》及證明材料。評審組負責對《糾正報告》及證明材料進行驗認和確認，必要時，對重點問題可進行現場驗證。
b)現場審查中，如發現嚴重不合格項，評審組可做出終止審查的決定。提交《終止現場審查通知單》，受審查方可在半年內提出復審申請。
c)對糾正措施無效以及未申明理由且超過規定的糾正措施期限未進行整改，或終止現場審查後，未在半年內提出復審申請的，撤銷其本次認證申請。
2、產品抽、送樣檢驗
申請認證的產品需要進行檢驗的，由評審組按申請認證產品情況，負責對申請認證產品進行抽樣或送樣安排，由香港環境保護總會指定檢驗機構進行檢驗。測試要求須由符合EN45001標準或同等標準的實驗室(即符合HOKLAS, ISO-IEC 25,或ISO/IEC/EN 17025(取代ISO-IEC 25 和EN4500))。香港實驗所認可計劃(HOKLAS)是一項由創新科技署轄下香港認可處(HKAS) 管理的認可計劃。此外,測試也可以由香港以外的實驗室來執行。因為香港驗所認可計劃已與來自42個經濟體系的53家認可機構轄下55項認可計劃簽訂相互承認協議。如需要個別認可計劃之聯絡資料,可瀏覽以下網站 :http://www.itc.gov.hk/ ch/quality/hkas/ hoklas/agreement.htm 。遞交的測試報告, 一般可接受的有效期為3 年。
五、出具綜合評估報告並送技術委員會評定
1、評審組根據企業申請材料、工廠審查報告、產品檢驗報告撰寫環保標誌認證綜合評估報告，提交技術委員會審查。
2、技術委員會按照評定依據，對評審組提交的綜合評估報告進行綜合評定，並簽署認證評定意見。
六、批准註冊和頒發證書
1、香港環境保護總會技術委員會的審查匯總，依據專家評定組的評定意見，做出認證證明與否的評定，由香港環境保護總會總幹事對符合環保標誌認證要求的申請方及其產品簽發環保標誌認證證書。
2、評定通過以後，受評審方應辦理以下註冊手續：a、簽訂《認證證書和環保標誌使用協議書》；b、領取環保標誌認證證書，辦理環保標誌使用事宜。
3、香港環境保護總會將對獲得認證的申請方和產品進行公告和宣傳。
七、標誌的使用
獲證企業如在產品的外包裝、產品說明書等處使用認證標識，應將應用方案向香港環境保護總會報備。
八、獲證後監督
1、監督頻次
一般情況，獲證8個月後即可安排監督評審，年度監督每年不少於一次，分別為獲證後十個月、二十個月、三十個月。若發生以下情況可增加監督頻次：
獲證產品出現嚴重問題或用戶提出嚴重投訴，並查實為證書持有者責任的；
有足夠的資訊表明生產製造商因變更組織機構、生產條件、環境管理體系等，從而影響產品相關性能時；
認證機構有足夠理由對獲證企業的重大環境因素的有效性控制提出質疑時。
2、監督內容
監督評審包括對獲證產品抽、送樣檢驗及需要時對獲證產品所涉及的工廠進行審查。
3、結果評價
a)監督評審合格後，可以繼續保持證書持有者的認證資格，允許使用認證標誌。監督評審發現的不合格項應在規定限期內進行整改。逾期將取消認證資格，停止使用認證標誌，並對公眾公告。
b)不能按規定要求接受監督評審的證書持有者，將終止和收回該證書持有者全部認證證書，並對公眾公告。
九、認證範圍的擴大
當獲證企業申請認證範圍擴大時，香港環境保護總會將按相關規定進行確認和處理。
1、新型號產品的擴大
與獲證產品產自同一生產場地、同一工藝的新型號產品申請擴大認證時，應按正常程式提交擴大認證申請書及相關材料。香港環境保護總會受理後，對申請產品進行抽、送樣，由指定機構進行產品檢驗。
2、同類型但不同系列/單元產品的擴大
與獲證產品產自同一生產場地、不同生產工藝的新系列/單元產品申請認證時，應按正常程式提交擴大認證申請書及相關材料。認證中心受理後，將安排工廠審查或產品抽、送樣，並將產品送至指定的檢驗機構進行檢驗。
3、新生產場地的擴大認證
當獲證產品增加一個新的生產場地時，應按正常程式提交擴大認證申請書及相關材料，認證中心受理後，對新生產場地按初始工廠審查的要求進行評審，新生產場地生產的已獲證產品型號一般不再抽樣檢驗，如有特殊則另行決定。
十、認證證書
1、證書的有效性
認證證書的有效期限為三年，認證企業每年通過定期的監督確保認證證書的有效性，獲得保持資格。未經年度有效性確認，則所持認證證書無效。
2、認證證書的變更
獲證後的產品，如果在產品工藝、配方、結構設計等沒有發生變動的前提下，其產品商標、名稱、型號變更、或獲證申請方名稱、生產廠名、生產場地發生變更時，證書持有者應向香港環境保護總會提出變更申請。認證機構根據證書變更的條件和程式對變更的內容和提供的資料進行評價，對符合要求的，批准換發新的認證證書，新證書的編號、批准有效日期保持不變，並注明換證日期。
3、申請複評
認證證書有效期滿，申請企業可按初次認證程式向認證機構提出複評申請。複評認證通過後，申請企業可獲得由認證機構頒發的新的認證證書。
